La Universitat de Girona (UdG) ha incorporado la colección Pergamins del Monestir de Sant Daniel al repositorio de la Memòria Digital de Catalunya (MDC). 

El Arxiu del Monestir de Sant Daniel de Girona (AMSDG) es el archivo histórico de la comunidad de Sant Daniel, y como tal, alberga documentación producida por ella misma, fruto de la actividad desde el siglo XI hasta inicios del siglo XX, y documentación externa a la comunidad, que ha reunido a lo largo de su vida por uno u otro motivo. El Arxiu custodia dos fondos y una colección:

• Monestir de Sant Daniel de Girona, 938 (abierto): fondo monacal producido por la comunidad de Sant Daniel de Girona como consecuencia de su actividad y de la de los monasterios que durante el siglo XV se annexionaron: Santa Margarida de la Garriga o de los Prats de Roses (1225-1461), Santa Maria del Mar de Calonge (c. 1241-1424) y Santa Maria de Valldemaria de Maçanet de la Selva (1158-1550). Consta de once metros lineales de documentación en papel y 1.409 pergaminos.

• Família Mallol de Vilopriu, s. XVI-XIX: fondo patrimonial producido y agrupado por diferentes generaciones de la Familia Mallol, una familia de payeses del pueblo de Vilopriu, que explotaban sus propiedades a lo largo del  valle del Llémena. Este fondo se ingresó durante la década de los sesenta del siglo XX por donación testamentaria del último miembro de esta familia, la señora Francisca Mallol Vilana, hermana de una de las monjas de Sant Daniel.

• Colección de Gozos del Monasterio de Sant Daniel de Girona.

La colección se encontrará próximamente catalogada en el Catálogo Colectivo de las Universidades de Cataluña (CCUC) y formará parte del portal de las colecciones especiales.